Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCND3P30281 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND3P30281 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND3P30281 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND3P30281 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND3P30281 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND3P30281 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND3P30281 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND3P30281 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND3P30281 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND3P30281 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms