Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND2P30279 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND2P30279 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCND2P30279 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND2P30279 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND2P30279 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND2P30279 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND2P30279 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND2P30279 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND2P30279 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND2P30279 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND2P30279 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND2P30279 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND2P30279 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND2P30279 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND2P30279 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND2P30279 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND2P30279 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND2P30279 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms