Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRMP28827 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms