Protein–RNA interactions for Protein: P28062

PSMB8, Proteasome subunit beta type-8, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB8P28062 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB8P28062 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms