Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms