Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO2P25791 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO2P25791 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO2P25791 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO2P25791 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO2P25791 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO2P25791 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO2P25791 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO2P25791 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO2P25791 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO2P25791 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms