Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTSSP25774 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms