Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms