Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms