Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT1P21579 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT1P21579 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT1P21579 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT1P21579 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT1P21579 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT1P21579 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT1P21579 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYT1P21579 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT1P21579 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms