Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSPP15924 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSPP15924 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSPP15924 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSPP15924 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSPP15924 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSPP15924 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSPP15924 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSPP15924 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DSPP15924 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms