Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA1P15085 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA1P15085 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA1P15085 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA1P15085 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA1P15085 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA1P15085 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA1P15085 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA1P15085 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA1P15085 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPA1P15085 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPA1P15085 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPA1P15085 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPA1P15085 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA1P15085 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA1P15085 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA1P15085 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA1P15085 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA1P15085 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA1P15085 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA1P15085 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA1P15085 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA1P15085 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA1P15085 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA1P15085 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA1P15085 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA1P15085 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA1P15085 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms