Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXB3P14651 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXB3P14651 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXB3P14651 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXB3P14651 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXB3P14651 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms