Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RLBP1P12271 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RLBP1P12271 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms