Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms