Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODC1P11926 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODC1P11926 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODC1P11926 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODC1P11926 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODC1P11926 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms