Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNAT1P11488 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNAT1P11488 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms