Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms