Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYH3P11055 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYH3P11055 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYH3P11055 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYH3P11055 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYH3P11055 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MYH3P11055 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYH3P11055 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYH3P11055 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH3P11055 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms