Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms