Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAA2P0DJI9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAA2P0DJI9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms