Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF1RP07333 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms