Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN1P04843 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN1P04843 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN1P04843 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN1P04843 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN1P04843 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms