Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms