Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOBTB3O94955 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms