Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEBLO76041 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEBLO76041 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEBLO76041 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEBLO76041 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEBLO76041 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEBLO76041 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEBLO76041 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEBLO76041 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEBLO76041 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NEBLO76041 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
NEBLO76041 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms