Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP9O75884 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms