Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA4O75676 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms