Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXTL3O43909 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms