Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms