Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms