Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD6O43541 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms