Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA2O43364 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA2O43364 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA2O43364 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA2O43364 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA2O43364 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms