Protein–RNA interactions for Protein: O15438

ABCC3, Canalicular multispecific organic anion transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3O15438 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC3O15438 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms