Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR1CO15160 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1CO15160 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms