Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBAG9O00559 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms