Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms