Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H7C1D1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H7C1D1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H7C1D1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H7C1D1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H7C1D1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H7C1D1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C1D1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C1D1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C1D1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C1D1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C1D1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C1D1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C1D1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C1D1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C1D1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C1D1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C1D1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C1D1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C1D1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H7C1D1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
H7C1D1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H7C1D1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms