Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DXG7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DXG7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4DXG7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4DXG7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4DXG7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4DXG7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4DXG7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4DXG7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DXG7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DXG7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms