Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEURL1BA8MQ27 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms