Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC85CA6NKD9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85CA6NKD9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms