Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA6CA6NDK9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA6CA6NDK9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms