Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL33A6NCF5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms