Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMB4A4D0S4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB4A4D0S4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms