Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms