Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD7-202ENST00000417525 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OR2G6-201ENST00000343414 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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