Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 RPEL1-201ENST00000441178 2130 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC131392.2-201ENST00000505635 4332 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms