Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL513548.2-201ENST00000602994 1207 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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