Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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COL4A6Q14031 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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COL4A6Q14031 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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COL4A6Q14031 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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