Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms